Muzejní činnosti Vojenského historického ústavu Praha zajišťují tři hlavní muzejní složky:
Armádní muzeum Žižkov - sedm expozic mapující vojenské dějiny českého území od počátků až po dnešek, značný prostor je také věnován české státnosti. Náročná rekonstrukce muzea významně rozšířila výstavní prostory. Nyní je výstavní plocha téměř 5 000 metrů čtverečních ve čtyřech patrech. Vystaveno je přes sedm tisíc exponátů v téměř třech stovkách vitrín. Výsledek byl oceněn jako Muzejní počin roku 2022, když získal cenu Gloria musaelis, oceněn byl také titulem Stavba roku .
Letecké muzeum Kbely - expozice věnovaná dějinám letectví s důrazem na československé a české vojenské letecké síly.
Vojenské technické muzeum Lešany - expozice věnovaná pozemní technice především domácí, ale i zahraniční provenience.
Národní památník hrdinů heydrichiády - umístěný v chrámu sv. Cyrila a Metoděje v Praze, připomínající boj čs. parašutistů za 2. světové války.
Jízdárna ruzyňských kasáren - pietní místo - Jízdárna se nachází v areálu vojenského útvaru, který je součástí spojovacího vojska Armády České republiky. Patří mezi nejautentičtější místa naší novodobé historie. Prohlídky možné na objednání v Národním památníku hrdinů heydrichiády
Národní památník na Vítkově s hrobem Neznámého vojína - pietní místo na vrchu Vítkov, kde se konají ceremoniální a pietní akce Armády České republiky, povyšování vojáků do vyšších hodností a další slavnostní nástupy. Od června 2024 je toto místo ve správě VHÚ Praha.